Chust là một trong những thành phố lâu đời nhất ở thung lũng Fergana. Các nghiên cứu khảo cổ học được tiến hành vào các năm 1953, 1957, 1959 và 1961 đã tìm thấy những đồ vật có niên đại từ cuối thời kỳ đồ đồng/đầu thời kỳ đồ sắt trong khu vực tương ứng với Chust ngày nay. Theo các nhà ngôn ngữ học địa phương, từ "chust" trong tiếng Ba Tư có nghĩa là "nhanh".

Vào thời Trung Cổ, Chust đã trở thành một pháo đài quan trọng. Cha của Babur là Umar Shaikh Mirza II đã đặt Chust làm nơi ở của mình vào năm 1480.[2] Đến thế kỷ 16, thành phố bao gồm một số pháo đài nhỏ.[3] Sau đó, một bức tường bao quanh các pháo đài này đã được xây dựng. Năm 1882, các bức tường của pháo đài bị phá hủy và thành phố bắt đầu được mở rộng.[3]

Theo thời gian, Chust trở thành một trung tâm công nghiệp quan trọng. Thợ rèn, thợ may, thợ gốm và thợ kim hoàn từ Chust trở nên nổi tiếng. Thành phố cũng được biết đến với các sản phẩm như mũ chỏm (Doʻppis) và dao.

Sau khi Nga mở rộng lãnh thổ sang Trung Á, một số nhà máy mới đã được xây dựng ở Chust. Năm 1912, có sáu nhà máy bông và một nhà máy da ở Chust. Đô thị này được đặt làm trung tâm hành chính của huyện Chust mới được thành lập vào năm 1926. Chust được nâng lên cấp thành phố vào năm 1969.[4]